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CFMD, la mayor base de datos de microorganismos alimentarios
Un proyecto internacional realizado a través del
Consorcio Master, en el que han participado investigadores del
CSIC y de la
Universidad de León, ha permitido crear una
base de datos con la información genética de los microorganismos habituales en alimentos y bebidas. La
CFMD, con relevantes aplicaciones, será de acceso libre
8 de septiembre de 2024, 08:00
Curated Food Metagenomic Database (CFMD) es una gran base de datos que recopila información genética de los microorganismos más habituales en los alimentos y bebidas que consumimos. En su creación han participado centros de investigación de distintos países, entre ellos el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) o la Universidad de León en España, asociados en el Consorcio Master (Microbiome Applications for Sustainable food systems through Technologies and EnteRprise) para este proyecto.
“Este recurso marcará un hito en la investigación en microbiología de alimentos”
El nuevo recurso va a permitir identificar y controlar los microorganismos indeseables, estudiar el movimiento de los microbios a lo largo de la cadena alimentaria y la propagación de genes de resistencia a antibióticos, además de mejorar los atributos saludables de los alimentos, entre otras aplicaciones.
Abelardo Margolles, investigador del Instituto de Productos Lácteos de Asturias (IPLA-CSIC), que ha participado en la elaboración de esta base de datos, ha destacado que “este recurso marcará un hito en la investigación en microbiología de alimentos”.
Además, el Consejo Superior de Investigaciones Científicas ha participado con investigadores de otros tres de sus centros: la Estación Experimental de El Zaidín (EEZ-CSIC), el Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL, CSIC-UAM) y el Instituto de Agroquímica y Tecnología de Alimentos (IATA-CSIC).
La base de datos, fruto del mayor estudio internacional sobre microbiomas de alimentos realizado hasta la fecha, va a ser de acceso libre para facilitar su aplicación a gran escala por parte del mundo académico y la industria. El estudio que ha permitido su configuración se publica en la revista científica Cell.
2.500 metagenomas
La creación de la Curated Food Metagenomic Database parte del análisis de los metagenomas (todo el material genético del conjunto de microorganismos de un ambiente) de cientos de alimentos de 50 países. En concreto, se han analizado más de 2.500 metagenomas asociados a alimentos, incluidos 1.950 metagenomas secuenciados por primera vez.
Los microbios asociados a la comida explican el 3% del microbioma intestinal de los adultos y el 56% del microbioma intestinal infantil
“Aproximadamente dos tercios de las muestras fueron de productos lácteos y las instalaciones en las que se elaboran; y se han analizado también bebidas y carnes fermentadas, entre otros alimentos”, ha señalado Margolles.
Los investigadores han logrado identificar 10.899 microbios asociados a la comida, la mitad de ellos especies desconocidas hasta ahora. Se ha podido determinar también que los microbios asociados a la comida explican el 3% del microbioma intestinal de los adultos y el 56% del microbioma intestinal infantil. La base contiene datos sobre 3.600 especies microbianas, incluyendo más de 200 nuevas especies.
“Este recurso ayudará a los investigadores a afrontar retos que hasta ahora eran muy difíciles de abordar debido a la escasez de metagenomas de alimentos disponibles en las bases de datos”, ha explicado Raúl Cabrera, investigador del programa de investigadoras e investigadores doctores de excelencia para desarrollar un proyecto de I+D+i en la Comunitat Valenciana (Cidegent) integrado en el grupo de Bacterias Lactícas y Probióticos del IATA, que ha aportado sus conocimientos bioinformáticos a esta investigación.
La CFMD posibilita también que los datos de metagenomas de alimentos basados en la secuenciación del ADN puedan analizarse con rapidez y precisión; frente a los métodos tradicionales que consistían en cultivar los microbios en caldos o placas de Petri, un proceso lento y no apto, además, para todos los microorganismos alimentarios.
El trabajo del CSIC
Los investigadores de los cuatro centros del CSIC que han participado en el proyecto se ha centrado en el análisis de quesos artesanales asturianos. “Se han analizado ambientes de 28 queserías pertenecientes a la Asociación de Queseros Artesanos del Principado de Asturias, y se ha comprobado que los quesos de cada instalación tienen características únicas”, ha indicado Margolles.
“Esto es importante porque se podría asociar la especificidad y la calidad de los alimentos locales a su microbioma, e incluso posibilita utilizar el metagenoma como un marcador de autenticidad del alimento, representado una poderosa herramienta para garantizar su trazabilidad y origen”.
El proyecto Master está financiado por el programa de la Unión Europea Horizonte 2020. Además del CSIF y la Universidad León, ha contado con las aportaciones de otros 27 socios, entre ellos un equipo de la Universidad de Trento (Italia) que ha gestionado la creación de la base de datos, investigadores de la Universidad de Nápoles Federico II (Italia), MATIS (Islandia) y FFoQSI (Austria). Ha sido coordinado por el profesor Paul Cotter (Teagasc, Irlanda).
